Pläne der NÖ Landesregierung weisen darauf hin, dass die geplante Waldviertelautobahn direkt durch das Gemeindegebiet von Hollabrunn führen könnte. Eine Variante wäre, dass die Transitstrecke bei Hollabrunn Mitte Richtung Oberfellabrunn abzweigt und dann Richtung Horn weiterverläuft. Aus diesem Grund werden in Oberfellabrunn und Groß bereits Unterschriften gegen das Mega-Projekt gesammelt. Die Grünen Hollabrunn unterstützen diesen Protest.

"Die Transitstrecke würde hunderte Hektar Ackerflächen und unberührte Natur zunichte machen", sagt Georg Ecker, Landtagsabgeordneter der Grünen. Er spricht sich auch im Landtag vehement gegen die Transitstrecke aus. Die Verbindung der S3 bis ins oberösterreichische Freistadt würde nämlich vor allem LKW-Transit anziehen und damit auch schlechte Luft, Feinstaub und Lärm nach Hollabrunn bringen. Die Grünen Hollabrunn fordern, statt Millionen in die Planung der Transitstrecke zu stecken, umgehend für den Ausbau der Nordwestbahn zu sorgen.